سنتز در هسته شیمی آلی قرار دارد جهت بررسی ترکیبات دارویی، مواد و امثال اینها، به دلیل خواص فیزیکی ویژه، از تهیه آنها در توالیهای سنتزی چندمرحلهای ناگزیر هستیم بدین ترتیب ترکیب هدف در خارجیترین لایۀ طراحی سنتز قرار میگیرد.
سنتز عبارت است از ایجاد ترکیب هدف از کوچکترین و دردسترسترین بلوکهای سازنده. آن گاه بلافاصله این پرسش مطرح میگردد که سنتز از چه بلوکهای سازنده و با چه واکنشی؟ طبیعت، بسیاری از "فراوردههای طبیعی" کاملا پیچیده را از طریق سریهای متوالی واکنشی ایجاد میکند، به نحوی که مجموعۀ ترکیبات آغازکنندۀ موجود درون سلول با فعل و انفعالات خاصی (برای هر ساختار هدف) از آنزیمهای تنظیم کننده در توالی ویژهای به ترکیب هدف تبدیل میگردند.تقلید از چنین واکنشهای کارآمدی در عرصۀ طبیعت، رویای هر سنتز آرمانی است با این حال، هم اکنون ما درحال تحقق بخشیدن به واکنش تک-ظرفی هستیم که در آن، سنتز واقعی ناگزیر است از طریق یک توالی خاص و جداگانه حاصل گردد. بدین ترتیب ما موظف به طراحی بهینه و منحصر به فرد برای هر سنتز هستیم.