یکی از اساسیترین عملکردهای سلول پروکاریوتی انتقال پروتئین از سیتوپلاسم به قسمتهای دیگر همان سلول، محیط و یا باکتریهای دیگر یا سلولهای یوکاریوتی است، این فرایند به عنوان «ترشح پروتئین» شناخته میشود. پروکاریوتها راههای زیادی برای انتقال بستهی پروتئینی بین مکانهای مختلف دارند که به طور عمده مربوط به سیستمهای ترشحی پروتئین میشود. سیستمهای ترشح پروتئین برای رشد باکتریها و همچنین در طیفی از فرایندها ضروری هستند.