ذخیره خوارزمشاهی مهمترین و مفصّلترین اثر اسماعیلبن حسین جرجانی.این کتاب درواقع نخستین دانشنامه جامع و حرفهای در زمینه پزشکی به زبان فارسی و نخستین اثر جامع جرجانی در پزشکی پس از ورودش به شهر خوارزم در ۵۰۴ است. او این کتاب را به قطبالدین محمد خوارزمشاه (حک: ۴۹۰ یا ۴۹۱ ـ۵۲۱) تقدیم کردهاست.