کشاورزی در استان خراسان جنوبی با وجود کم آبی و تسلسل دوره های طولانی خشکسالی باز هم بیشترین اشتغال را به خود اختصاص داده است اما کم آبی و فرآیند خشکسالی و خشکیدن قنات ها و چشمه ها و به دنبال آن مهاجرت و کوچ روستاییان به مراکز شهری و پاره ای از مسایل اجتماعی، کمبود نیروی کار در مراکز تولیدی کشاورزی از مشکلاتی است که فرآیند تولید محصولات را به شدت تحت تأثیر قرار داده است. گسترش خرده مالکی با واگرایی تصاعدی روز به روز از امکان مکانیزاسیون کشاورزی می کاهد. پروسه ی تجمیع و یکپارچه سازی زمین های کشاورزی از شتاب لازم برخوردار نیست.
کم آبی و تغییرات آب و هوایی و خشکسالی های ممتد با وجود این که ضربات مهلکی بر پیکره ی کشاورزی منطقه وارد نموده است اما تلاش و مقاومت مضاعفی را در تولیدکنندگان همراه با شیوه های تولیدی بهینه، القا نموده است.
توجه به جداول و آماری که نشانگر تولید محصولات مختلف در خراسان جنوبی است، این نکته را به درستی روشن می سازد که با وجود همه محدودیت ها، هنوز هم تولیدات زراعی و باغی از میزان قابل قبولی برخوردار است.