آیتالله امینی، نماینده تفکر روزآمد حوزه است. اندیشه های ایشان در مسائل تربیتی، عقیدتی، اجتماعی و سیاسی، راه را برای بسیاری از تحولات حوزوی گشود. اگر اکنون حوزه علمیه قم، سرشار از مؤسسات و مراکز تحقیقی در میان رشته هایی مانند تربیت دینی است، حاصل اندیشه ورزی های آیت الله امینی و هم قطاران ایشان در دهه های چهل و پنجاه است. در روزگاری که حوزه در دایره فقه و اصول محصور بود، بلندهمتانی همچون او به دردها و نیازهای روز نیز اندیشیدند و چاره جویی کردند. از امتیازهای مهم و تأثیرگذار روش علمی ایشان، توجه به ابعاد اجتماعی دین است.